Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 IRAK1-213ENST00000477274 705 ntTSL 512.37□□□□□ -0.437e-7■■■■■ 38.4
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EFTUD2Q15029 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.62e-8■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 APH1A-201ENST00000236017 663 ntTSL 216.81■□□□□ 0.282e-8■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.232e-8■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 APH1A-205ENST00000461320 1038 ntTSL 311.54□□□□□ -0.562e-8■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 RALGDS-212ENST00000493067 217 ntTSL 210.37□□□□□ -0.753e-7■■■■■ 38.4
EFTUD2Q15029 CPSF7-212ENST00000489728 488 ntTSL 410.68□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 RGS14-202ENST00000425155 2329 ntTSL 220.41■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 RGS14-212ENST00000514102 875 ntTSL 216.78■□□□□ 0.284e-6■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 RGS14-209ENST00000511890 1536 ntTSL 1 (best)16.66■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 RGS14-204ENST00000503044 458 ntTSL 216.24■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 RGS14-207ENST00000506944 590 ntTSL 213.09□□□□□ -0.314e-6■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.76e-7■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 B4GALT4-213ENST00000479150 615 ntTSL 416.54■□□□□ 0.246e-7■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 B4GALT4-208ENST00000470111 641 ntTSL 316.54■□□□□ 0.246e-7■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 FAN1-206ENST00000565280 4999 ntTSL 1 (best)14.46□□□□□ -0.16e-7■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.126e-7■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 FAN1-208ENST00000568145 851 ntTSL 313.29□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 FAN1-204ENST00000562881 525 ntTSL 312.89□□□□□ -0.356e-7■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 FAN1-201ENST00000362065 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.366e-7■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 SNHG11-211ENST00000444816 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.76e-7■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 STK11IP-207ENST00000466648 594 ntTSL 39.61□□□□□ -0.876e-7■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 B4GALT4-212ENST00000475803 884 ntTSL 49.58□□□□□ -0.886e-7■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 B4GALT4-203ENST00000459778 611 ntTSL 48.94□□□□□ -0.986e-7■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 B4GALT4-217ENST00000484595 598 ntTSL 48.94□□□□□ -0.986e-7■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 B4GALT4-219ENST00000491906 563 ntTSL 48.5□□□□□ -1.056e-7■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 B4GALT4-205ENST00000460321 835 ntTSL 27.92□□□□□ -1.146e-7■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 B4GALT4-207ENST00000467604 5794 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.176e-7■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 B4GALT4-218ENST00000487579 582 ntTSL 46.75□□□□□ -1.336e-7■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 B4GALT4-204ENST00000459820 582 ntTSL 36.48□□□□□ -1.376e-7■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 B4GALT4-206ENST00000460395 620 ntTSL 46.48□□□□□ -1.376e-7■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 E2F4-204ENST00000564718 688 ntTSL 311.74□□□□□ -0.537e-7■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.013e-6■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 AP1M1-203ENST00000444449 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.223e-6■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.123e-6■■■■■ 38.3
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EFTUD2Q15029 DNPEP-215ENST00000519698 482 ntTSL 310.79□□□□□ -0.683e-8■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.049e-7■■■■■ 38.3
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EFTUD2Q15029 POLG-217ENST00000636774 4151 ntTSL 513.22□□□□□ -0.299e-7■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.553e-7■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.113e-7■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.624e-7■■■■■ 38.3
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EFTUD2Q15029 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.322e-6■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 38.3
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EFTUD2Q15029 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.53e-8■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 ILF3-202ENST00000407004 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.453e-8■■■■■ 38.3
EFTUD2Q15029 ILF3-208ENST00000587928 4230 ntTSL 211.26□□□□□ -0.613e-8■■■■■ 38.3
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EFTUD2Q15029 RECQL5-201ENST00000317905 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 38.3
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EFTUD2Q15029 RICTOR-209ENST00000514735 686 ntTSL 37.9□□□□□ -1.144e-11■■■■■ 38.2
EFTUD2Q15029 RICTOR-208ENST00000513566 1762 ntTSL 1 (best)6.65□□□□□ -1.344e-11■■■■■ 38.2
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EFTUD2Q15029 PC-206ENST00000528224 1008 ntTSL 214.71□□□□□ -0.055e-8■■■■■ 38.2
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EFTUD2Q15029 WDR74-203ENST00000453708 617 ntTSL 218.84■□□□□ 0.615e-8■■■■■ 38.2
EFTUD2Q15029 WDR74-217ENST00000545112 788 ntTSL 218.28■□□□□ 0.525e-8■■■■■ 38.2
EFTUD2Q15029 WDR74-210ENST00000538277 565 ntTSL 418.1■□□□□ 0.495e-8■■■■■ 38.2
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EFTUD2Q15029 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.293e-8■■■■■ 38.2
EFTUD2Q15029 PAF1-205ENST00000595797 760 ntTSL 311.79□□□□□ -0.524e-25■■■■■ 38.2
EFTUD2Q15029 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.443e-6■■■■■ 38.2
EFTUD2Q15029 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 38.2
EFTUD2Q15029 DHX38-211ENST00000567552 1028 ntTSL 217.28■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 38.2
EFTUD2Q15029 DHX38-210ENST00000567142 892 ntTSL 217.28■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 38.2
EFTUD2Q15029 DHX38-204ENST00000563819 706 ntTSL 311.39□□□□□ -0.591e-8■■■■■ 38.2
EFTUD2Q15029 AC008763.2-201ENST00000598664 537 ntAPPRIS P5 TSL 515.21■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 38.2
EFTUD2Q15029 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 38.2
EFTUD2Q15029 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.882e-7■■■■■ 38.2
EFTUD2Q15029 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.088e-7■■■■■ 38.2
EFTUD2Q15029 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.088e-7■■■■■ 38.2
EFTUD2Q15029 NXF1-210ENST00000531579 590 ntTSL 414.26□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 38.2
EFTUD2Q15029 NXF1-207ENST00000530875 1922 ntTSL 1 (best)13.98□□□□□ -0.178e-7■■■■■ 38.2
EFTUD2Q15029 NXF1-211ENST00000531709 4128 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.58e-7■■■■■ 38.2
EFTUD2Q15029 NXF1-203ENST00000526163 569 ntTSL 410.96□□□□□ -0.655e-8■■■■■ 38.2
EFTUD2Q15029 FPGS-211ENST00000475270 560 ntTSL 212.02□□□□□ -0.491e-10■■■■■ 38.2
EFTUD2Q15029 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 38.2
EFTUD2Q15029 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 DGCR8-210ENST00000498171 3661 ntTSL 1 (best)12.19□□□□□ -0.466e-10■■■■■ 38.1
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EFTUD2Q15029 RAB40C-211ENST00000568586 648 ntTSL 227.72■■■□□ 2.037e-7■■■■■ 38.1
EFTUD2Q15029 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.97e-7■■■■■ 38.1
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