Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTTNQ14247 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms