Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RUNX3Q13761 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
RUNX3Q13761 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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