Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
XRCC4Q13426 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
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