Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MSLNQ13421 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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