Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STX4Q12846 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STX4Q12846 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STX4Q12846 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STX4Q12846 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STX4Q12846 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STX4Q12846 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STX4Q12846 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
STX4Q12846 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STX4Q12846 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
STX4Q12846 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
STX4Q12846 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
STX4Q12846 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
STX4Q12846 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
STX4Q12846 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
STX4Q12846 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
STX4Q12846 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
STX4Q12846 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
STX4Q12846 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
STX4Q12846 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
STX4Q12846 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
STX4Q12846 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
STX4Q12846 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
STX4Q12846 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
STX4Q12846 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
STX4Q12846 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
STX4Q12846 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
STX4Q12846 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
STX4Q12846 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
STX4Q12846 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
STX4Q12846 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
STX4Q12846 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
STX4Q12846 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
STX4Q12846 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
STX4Q12846 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
STX4Q12846 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
STX4Q12846 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
STX4Q12846 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STX4Q12846 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STX4Q12846 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
STX4Q12846 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STX4Q12846 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
STX4Q12846 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STX4Q12846 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STX4Q12846 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
STX4Q12846 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms