Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms