Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPEQ02224 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CENPEQ02224 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms