Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF2BQ00403 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF2BQ00403 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms