Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CSNK2A1P68400 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSNK2A1P68400 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms