Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL11P62913 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL11P62913 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL11P62913 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL11P62913 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL11P62913 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL11P62913 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL11P62913 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL11P62913 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL11P62913 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL11P62913 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL11P62913 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL11P62913 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL11P62913 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL11P62913 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL11P62913 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL11P62913 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL11P62913 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPL11P62913 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RPL11P62913 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RPL11P62913 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL11P62913 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL11P62913 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL11P62913 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL11P62913 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL11P62913 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL11P62913 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL11P62913 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL11P62913 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL11P62913 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL11P62913 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL11P62913 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL11P62913 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL11P62913 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL11P62913 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RPL11P62913 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms