Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2FP61218 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms