Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITPNBP48739 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITPNBP48739 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms