Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACADSBP45954 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACADSBP45954 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms