Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXA13P31271 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXA13P31271 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms