Protein–RNA interactions for Protein: P26572

MGAT1, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 2-beta-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT1P26572 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT1P26572 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MGAT1P26572 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MGAT1P26572 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MGAT1P26572 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MGAT1P26572 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms