Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXB9P17482 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXB9P17482 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms