Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGB4P16144 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGB4P16144 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms