Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HLA-DOBP13765 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HLA-DOBP13765 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms