Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTXN2P0C2S0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTXN2P0C2S0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms