Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DYNC1LI2O43237 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI2O43237 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI2O43237 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI2O43237 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI2O43237 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI2O43237 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI2O43237 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI2O43237 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI2O43237 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI2O43237 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI2O43237 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI2O43237 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI2O43237 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI2O43237 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI2O43237 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DYNC1LI2O43237 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms