Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 CWC15-201ENST00000279839 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 MYT1L-AS1-202ENST00000448106 3230 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 SLC26A9-202ENST00000367134 4616 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 ZNF544-201ENST00000269829 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 SCNN1G-201ENST00000300061 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 GULP1-202ENST00000409580 3544 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 TMEM136-204ENST00000529187 3930 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 FAM13A-201ENST00000264344 5858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 KIAA1524-201ENST00000295746 4075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 SLC31A1-201ENST00000374212 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 HINFP-201ENST00000350777 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 MKL2-205ENST00000572567 2185 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 DDX24-209ENST00000621632 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 CREM-212ENST00000374728 1933 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 LINC00689-203ENST00000438049 3946 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 ZMAT4-201ENST00000297737 2466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 ALKBH8-202ENST00000389568 2491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 MAPK10-301ENST00000641313 2482 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 USP17L26-202ENST00000610514 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 USP17L20-202ENST00000613757 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 USP17L11-202ENST00000613973 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 USP17L17-202ENST00000614762 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 USP17L19-202ENST00000615989 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 USP17L13-202ENST00000616303 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 USP17L18-202ENST00000619296 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 USP17L25-202ENST00000621472 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 USP17L22-202ENST00000622009 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 USP17L24-202ENST00000622713 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 OR2G6-201ENST00000343414 1049 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 EIF4A1P8-201ENST00000394444 1190 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 MT1X-201ENST00000394485 450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 AL590286.1-201ENST00000404178 291 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 AL117378.1-202ENST00000421310 601 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 SATB1-AS1-202ENST00000425799 611 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 AC103563.4-201ENST00000454384 368 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 AC018638.4-201ENST00000465971 1150 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 RN7SL554P-201ENST00000468197 292 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 RN7SL236P-201ENST00000484759 284 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 GAPDHP47-201ENST00000489113 999 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 AC105345.2-201ENST00000515186 664 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 AC109588.1-202ENST00000515720 880 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 FAXDC2-206ENST00000518651 536 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 RPS3-207ENST00000526608 710 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 ANKRD42-206ENST00000528722 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 CRYAB-215ENST00000533971 981 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 CCDC60-204ENST00000539847 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 LINC02321-201ENST00000555975 384 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 LINC00520-204ENST00000556417 778 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 AC013457.1-201ENST00000556770 1011 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 NR2F2-AS1-205ENST00000559505 1005 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 AC024270.3-201ENST00000565513 396 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 RN7SL118P-201ENST00000580570 302 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 SCML2P1-201ENST00000584511 1100 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 AC004257.1-201ENST00000593588 277 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 PSG10P-202ENST00000597171 1283 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 AC093458.1-201ENST00000608912 222 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 LINC00635-221ENST00000609366 784 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 AL139123.1-201ENST00000612008 430 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 CPSF7-226ENST00000626926 306 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 ZNF410-225ENST00000639051 936 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 SAMMSON-214ENST00000641395 1264 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 PTPRR-203ENST00000378778 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 ARNTL2-201ENST00000261178 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 AL031123.2-201ENST00000563225 3325 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
SYT9Q86SS6 AC023154.1-201ENST00000510351 2517 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms