Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 ZNF121-201ENST00000320451 1563 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 LIMA1-202ENST00000394943 3669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 SLC24A1-209ENST00000537259 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 EFCAB1-201ENST00000262103 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 TTC39B-208ENST00000512701 10483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 SCARB2-211ENST00000638603 4284 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 LINC01829-202ENST00000433133 2100 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 HSD17B4-220ENST00000513628 2225 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 ZNF136-201ENST00000343979 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 B3GALT1-201ENST00000392690 5094 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 OR51L1-201ENST00000321543 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 AL139806.1-201ENST00000403057 1002 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 EMX2OS-201ENST00000412075 1025 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 AC073987.1-201ENST00000422683 638 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 PIP5K1P2-201ENST00000437005 1120 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 IGKV1OR2-2-201ENST00000451163 355 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 DPH5-211ENST00000488176 1034 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 LINC00992-201ENST00000504107 617 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 AP000435.1-201ENST00000528539 496 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 EAPP-205ENST00000618169 1237 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 AC017037.4-201ENST00000624526 826 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 LINC01173-201ENST00000629370 331 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 SLC9A6-214ENST00000637581 4872 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 LDHA-206ENST00000430553 1310 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 TTC33-201ENST00000337702 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 HABP2-203ENST00000542051 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 CD44-208ENST00000428726 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 FAM13A-AS1-202ENST00000511543 2453 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 CASP10-206ENST00000374650 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 NFIA-AS2-202ENST00000421455 768 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 AL138930.1-201ENST00000446952 635 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SFTPCP11686 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms