Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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USP18Q9UMW8 AC078909.2-201ENST00000620584 398 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 AL132796.3-201ENST00000624703 900 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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USP18Q9UMW8 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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USP18Q9UMW8 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
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USP18Q9UMW8 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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USP18Q9UMW8 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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USP18Q9UMW8 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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USP18Q9UMW8 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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USP18Q9UMW8 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 GPCPD1-201ENST00000379019 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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USP18Q9UMW8 DCP2-201ENST00000389063 8947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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USP18Q9UMW8 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 PROX1-202ENST00000366958 8240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 AP000866.1-202ENST00000529392 2792 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 RNU4-81P-201ENST00000363561 144 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 UGT1A6-203ENST00000406651 785 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 RN7SKP232-201ENST00000410170 290 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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