Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 MED31-201ENST00000225728 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 RBM26-AS1-202ENST00000606049 2427 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
RTL8BQ17RB0 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 VN2R1P-201ENST00000449668 1743 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 HESX1-201ENST00000295934 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 MLXIP-203ENST00000377037 805 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 LINC01687-203ENST00000420255 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 MIR181A1HG-202ENST00000432296 930 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC139769.1-201ENST00000471224 1001 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC097494.1-201ENST00000512898 732 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC104574.1-201ENST00000561182 925 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AL161931.1-201ENST00000612768 246 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC008626.2-201ENST00000624425 248 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AL392046.2-202ENST00000635301 1113 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 CREM-216ENST00000429130 1476 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 GOT2P1-201ENST00000440922 1309 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 MARK2P4-201ENST00000503381 2380 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 ENPP3-203ENST00000414305 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 TTC33-207ENST00000637375 1824 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC015969.1-201ENST00000366218 1416 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 ATG12-202ENST00000500945 1430 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 RPL24P4-201ENST00000326586 421 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 C1orf162-202ENST00000369718 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AP001468.1-201ENST00000415026 557 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AL583805.2-201ENST00000418571 486 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 CLIC4P3-201ENST00000422221 752 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 TBX18-AS1-201ENST00000423086 421 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 OR13C7-201ENST00000424348 959 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AL353653.1-202ENST00000435177 539 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 LINC00271-203ENST00000438618 1202 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 RPL6P24-201ENST00000445338 864 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 LINC01961-201ENST00000449954 745 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC114755.1-201ENST00000453101 868 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AL096803.1-201ENST00000456921 1021 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC074386.1-206ENST00000487102 761 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
RTL8BQ17RB0 AC092436.4-201ENST00000510905 483 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
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