Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 THAP2-202ENST00000547843 672 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL136018.1-202ENST00000555300 488 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC116903.1-201ENST00000557683 539 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC092757.2-201ENST00000559026 633 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 DNM1P34-202ENST00000567850 315 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC027796.5-201ENST00000573568 560 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 GATA6-AS1-201ENST00000579431 481 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AP005210.1-201ENST00000583659 544 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC093484.4-201ENST00000583934 461 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 TTN-AS1-218ENST00000586452 828 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC008991.1-201ENST00000591285 537 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ZNF525-206ENST00000593918 590 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MARK3P1-201ENST00000604796 643 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC010680.5-201ENST00000605021 463 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 OR10AE1P-201ENST00000606962 1029 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL133520.1-201ENST00000610430 700 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MIR7162-201ENST00000611134 69 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL451054.1-201ENST00000621770 772 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC004943.1-203ENST00000624370 1074 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 PTP4A1-206ENST00000627002 447 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CYP2C18-201ENST00000285979 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 PSMD5-AS1-213ENST00000640327 3531 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 FGL1-202ENST00000381841 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 C12orf77-202ENST00000549262 1443 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 OR4F17-203ENST00000618231 2586 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 SLC14A1-221ENST00000619403 3823 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ADI1-202ENST00000382093 3870 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL161891.1-201ENST00000621575 4636 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 FBXW10-202ENST00000308799 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 OCM-201ENST00000242104 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RNU1-122P-201ENST00000365538 156 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 TSACC-202ENST00000368252 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 MIR575-201ENST00000385013 94 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 VN2R17P-201ENST00000391712 832 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 OR4E2-201ENST00000408935 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 BCRP8-201ENST00000412037 255 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC005999.1-201ENST00000414409 588 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC243547.1-201ENST00000415065 408 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 OCM-202ENST00000416608 623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AL391863.1-201ENST00000422776 743 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPREB1P12018 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms