Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 PLCG2-201ENST00000359376 3819 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 LPIN1-202ENST00000396097 5690 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 FBXL13-201ENST00000313221 2744 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 DRP2-205ENST00000541709 6835 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 TRPM3-204ENST00000360823 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 ADGRG7-201ENST00000273352 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 CAPRIN1-209ENST00000530820 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 C11orf54-207ENST00000528288 4094 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 SPATS2-222ENST00000552918 2993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 FLJ42393-201ENST00000623801 2270 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 FKBP15-201ENST00000238256 4336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 PHF6-202ENST00000370799 4186 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 SSBP2-201ENST00000320672 8780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 ZNF845-202ENST00000595091 4413 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 CD300E-201ENST00000392619 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 TSC1-208ENST00000545250 8310 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC244100.3-202ENST00000617328 1721 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC003989.1-201ENST00000434569 565 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 SAMMSON-214ENST00000641395 1264 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 PALM2-AKAP2-201ENST00000302798 4718 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 CHIC1-201ENST00000373502 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 CDH6-201ENST00000265071 8476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 TRIM5-203ENST00000396847 3170 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 MALAT1-202ENST00000534336 8708 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 DIEXF-202ENST00000491415 8446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 GCNT2-202ENST00000316170 4381 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 ZNF225-201ENST00000262894 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AF131215.2-201ENST00000531549 1710 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 ZNF350-201ENST00000243644 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 OR4F17-201ENST00000318050 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 OR4F4-201ENST00000326183 1054 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 NRIR-201ENST00000366140 799 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC004870.2-201ENST00000445615 831 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
PTCH1Q13635 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
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