Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 OR13F1-201ENST00000334726 960 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 TAAR2-202ENST00000367931 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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CDH18Q13634 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 RPL23AP28-201ENST00000448062 470 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 LINC00349-201ENST00000448748 841 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 RN7SL259P-201ENST00000478499 253 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 AC087672.3-201ENST00000519323 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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CDH18Q13634 OR5BK1P-201ENST00000550421 823 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 OR7A1P-201ENST00000601206 970 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 AC006328.2-201ENST00000623198 397 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 AC012005.2-201ENST00000624333 397 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 ZNF229-203ENST00000613197 4835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 LRTOMT-210ENST00000447974 2007 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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CDH18Q13634 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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CDH18Q13634 AQP4-205ENST00000581374 1586 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 PRL-202ENST00000615510 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
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CDH18Q13634 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 CYP4A22-206ENST00000619754 2351 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 ERRFI1-202ENST00000467067 2097 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 NBPF3-202ENST00000318249 3591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 RSAD2-201ENST00000382040 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
CDH18Q13634 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
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