Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 OR10R2-203ENST00000641400 975 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 ATAD1-202ENST00000328142 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 LEKR1-204ENST00000470811 2881 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM20A-207ENST00000619787 2798 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AKR1C4-201ENST00000263126 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR205HG-201ENST00000366437 704 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 MIR301B-201ENST00000390813 78 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A5P7-201ENST00000406156 896 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 RNA5SP177-201ENST00000410122 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 MKX-AS1-201ENST00000412244 745 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001468.1-201ENST00000415026 557 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AC019185.3-201ENST00000438805 323 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 HGF-206ENST00000444829 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL392P-201ENST00000473024 299 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AP003438.1-201ENST00000518704 435 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011410.1-201ENST00000524175 705 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AC103681.2-201ENST00000527450 567 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMC1P8-201ENST00000536820 1296 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AP006587.6-201ENST00000582128 1091 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF397-211ENST00000592264 1104 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 EXOSC3P2-201ENST00000594464 497 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TRAPPC6BQ86SZ2 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 PAPPA-AS2-201ENST00000438048 1854 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC015969.1-201ENST00000366218 1416 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS6KA6-201ENST00000262752 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 TRDMT1-210ENST00000488990 1301 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM111B-201ENST00000343597 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SKP55-201ENST00000364888 307 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 C6orf106-201ENST00000374021 916 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 NRIR-202ENST00000414795 506 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL29P7-201ENST00000440227 457 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01638-202ENST00000444114 637 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 RPL21P33-201ENST00000444831 484 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 RPLP0P1-201ENST00000457002 361 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012158.1-202ENST00000482431 1132 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC104009.1-201ENST00000528009 635 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM7-208ENST00000545678 867 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 FRG2IP-201ENST00000563581 781 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004381.1-201ENST00000565498 351 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL17A-205ENST00000573185 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
TRAPPC6BQ86SZ2 ARL17B-206ENST00000575698 581 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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