Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AL023806.2-201ENST00000603042 263 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 EAPP-205ENST00000618169 1237 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 uc_338.37-201ENST00000620113 186 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 POT1-AS1-204ENST00000449642 3238 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 UBE2V1-201ENST00000340309 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 KDELC2-202ENST00000434945 4374 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 EIF2A-202ENST00000406576 1795 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 GPR19-203ENST00000540510 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 HCG18-244ENST00000602516 2890 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 ASB8-201ENST00000317697 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 INPP4B-212ENST00000507861 1506 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 HSD17B13-202ENST00000328546 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 NRIR-201ENST00000366140 799 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 SNORA70.8-201ENST00000384231 136 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 RNU6-1055P-201ENST00000391085 107 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 OR7E117P-201ENST00000422682 1112 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 LINC00462-201ENST00000425350 962 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 ANAPC5-204ENST00000441917 2147 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
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USP18Q9UMW8 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 MEPE-208ENST00000540395 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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USP18Q9UMW8 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 EFCAB8-204ENST00000618684 435 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 CASC19-232ENST00000641480 1244 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 LYSMD3-203ENST00000500869 3863 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 KCNMB2-201ENST00000358316 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 TMC5-206ENST00000561503 2487 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
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USP18Q9UMW8 TBCCD1-203ENST00000424280 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
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USP18Q9UMW8 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 CASP10-203ENST00000313728 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 DYNC1I2P1-201ENST00000435916 1838 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
USP18Q9UMW8 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 TMEM59-204ENST00000371344 2473 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 LINC02347-201ENST00000397346 2458 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 MMP10-201ENST00000279441 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 HNRNPH1P2-201ENST00000396845 1210 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 OSTN-AS1-201ENST00000430375 515 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 AC073842.2-201ENST00000494221 572 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 AC068790.1-201ENST00000536166 355 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
USP18Q9UMW8 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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