Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 TEKT1-201ENST00000338694 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 INTS12-202ENST00000394735 1927 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AC005839.1-201ENST00000624148 3213 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 ATP6V0E1-201ENST00000265093 773 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 MTIF3-203ENST00000405591 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AC091492.1-201ENST00000419844 272 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AC245140.1-201ENST00000433825 341 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 PGBD4P1-201ENST00000473644 407 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 ZNF138-207ENST00000494380 842 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AC008906.1-201ENST00000512856 993 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AP000426.1-201ENST00000518749 361 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 ASCL3-201ENST00000531618 633 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AC010519.1-201ENST00000599924 344 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AL590542.1-201ENST00000449314 1596 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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SEMA3CQ99985 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 FABP3-201ENST00000373713 725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 XAGE5-202ENST00000375501 415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 CDK7P1-201ENST00000434574 693 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 BMS1P11-201ENST00000442351 885 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 BMS1P9-201ENST00000457640 885 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AC063955.1-201ENST00000462872 685 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 RN7SL143P-201ENST00000496780 297 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AC079921.2-201ENST00000507579 455 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 MTCYBP44-201ENST00000514835 823 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AC116158.2-201ENST00000559544 553 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AL512605.1-201ENST00000588215 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SEMA3CQ99985 FP325318.1-201ENST00000616097 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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