Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 MIR1273F-201ENST00000580581 99 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 AC110603.1-201ENST00000580645 468 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 MIR4786-201ENST00000583954 80 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 NCOA4-206ENST00000585056 2124 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 AC092032.1-201ENST00000603090 165 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 AC025287.2-201ENST00000621911 668 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 DTNA-201ENST00000269192 1964 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 CDY5P-201ENST00000411487 1580 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 CDY9P-201ENST00000451397 1580 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 TEX11-204ENST00000395889 3133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 HHLA3-203ENST00000370940 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 RNU2-5P-201ENST00000410533 180 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 AP001043.1-203ENST00000415824 407 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 AL451164.1-201ENST00000417149 390 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 GAPDHP69-201ENST00000425504 1008 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 AL136528.1-201ENST00000443034 754 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 AL139135.2-201ENST00000445040 433 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 AL391863.1-202ENST00000457427 612 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 RN7SL187P-201ENST00000495587 303 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 TECRP2-201ENST00000503270 928 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 FBXO16-208ENST00000519471 398 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 AC083967.1-201ENST00000522354 515 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 RRM1-AS1-201ENST00000529323 346 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 ELMO2P1-201ENST00000611569 473 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 AC068234.2-201ENST00000619646 522 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 A1CF-206ENST00000395489 9517 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 TTC33-207ENST00000637375 1824 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
IMPG1Q17R60 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AC100810.3-201ENST00000633189 2240 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 AP003066.1-201ENST00000527528 1647 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 KIAA1524-207ENST00000619684 2839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 LACRT-201ENST00000257867 551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 SPAG11B-201ENST00000297498 795 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
IMPG1Q17R60 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.9 ms