Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 SMARCA2-211ENST00000417599 980 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 GALNTL5-206ENST00000431418 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 MYO5BP3-201ENST00000431872 1279 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 NREP-217ENST00000509025 987 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 STX18-IT1-201ENST00000515487 542 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 RNA5SP318-201ENST00000516352 92 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC009117.3-201ENST00000568136 543 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC016405.2-201ENST00000607393 312 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 MSANTD3-206ENST00000613183 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AL161420.1-201ENST00000619393 264 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AL450426.1-201ENST00000635678 1602 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AGBL1-205ENST00000635782 3201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 MRPS31P5-201ENST00000416599 3494 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC009318.1-201ENST00000553105 2380 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 IL18RAP-202ENST00000409369 1890 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 CCDC150-201ENST00000389175 3685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 LINC00641-202ENST00000555688 1763 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 GPX6-204ENST00000612264 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 LUZP1-203ENST00000418342 8421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 TAAR2-202ENST00000367931 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 TRAV12-3-201ENST00000390442 399 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 FABP5P1-201ENST00000423401 411 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 FTH1P5-201ENST00000425761 545 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AGKP1-201ENST00000455254 1263 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 RPSAP7-201ENST00000456871 885 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC087672.3-201ENST00000519323 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC084851.2-201ENST00000530377 364 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC026458.1-201ENST00000564330 438 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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HOXD12P35452 AC016747.2-203ENST00000606876 289 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 RMDN2-AS1-210ENST00000630021 1053 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 NBPF14-201ENST00000581201 2931 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 DAZ2-208ENST00000400493 3516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 CEP57-207ENST00000537677 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
HOXD12P35452 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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