Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 RPL23AP8-201ENST00000479812 475 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 PEX11A-205ENST00000561257 978 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 AL161729.2-201ENST00000605700 456 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 RAB28P4-201ENST00000622233 665 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 AC127071.1-201ENST00000624997 712 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 HNRNPA1P54-201ENST00000411857 9714 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 AC110998.1-201ENST00000519029 2053 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 CTAGE1-201ENST00000391403 4313 ntAPPRIS P2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 CNR1-202ENST00000369499 5549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 C11orf63-203ENST00000531316 2782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 BDNF-206ENST00000395983 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 SERPINB13-202ENST00000344731 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 CTH-202ENST00000370938 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 RNF139-AS1-201ENST00000499418 5654 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 MT-CO1-201ENST00000361624 1542 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
POLD1P28340 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 SCIN-201ENST00000297029 9713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 GCNT7-202ENST00000617620 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 ZNF658-206ENST00000621410 4025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 TIMM21-204ENST00000580087 2524 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 FCHSD2-202ENST00000409263 932 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 LINC01384-201ENST00000422494 659 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 AL645568.1-202ENST00000437190 1016 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 PGM5P3-AS1-202ENST00000442069 615 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 AP000805.1-201ENST00000471604 784 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 LINC01919-201ENST00000578610 568 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 AC114776.1-201ENST00000414159 4395 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 AL034397.3-202ENST00000621933 1815 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 CD109-203ENST00000437994 9401 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 FGFR1OP-202ENST00000366847 14166 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 PTPRT-211ENST00000618610 3230 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 IFNA13-202ENST00000610660 1539 ntAPPRIS P2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 NEK1-208ENST00000512193 4430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 SAMMSON-222ENST00000641901 2727 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
POLD1P28340 EYA1-202ENST00000340726 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 UGT2B28-201ENST00000335568 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 MORC1-202ENST00000483760 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 VCAM1-204ENST00000370119 2483 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 YAF2-201ENST00000327791 4156 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 ZNF484-203ENST00000395505 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 ASIC5-201ENST00000537611 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 AL023806.3-201ENST00000638502 2704 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 OR4A16-201ENST00000314721 1081 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 RPL5P34-201ENST00000426545 891 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 AL954705.1-201ENST00000435277 559 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 AC026391.1-201ENST00000450677 537 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
POLD1P28340 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms