Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AC025287.2-201ENST00000621911 668 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 C18orf12-201ENST00000623329 537 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC084782.1-201ENST00000564401 2465 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 RASGRP3-203ENST00000407811 4210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 CREM-203ENST00000344351 1625 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 ZNF268-209ENST00000541009 3773 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 Z93022.1-201ENST00000433228 1554 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC106872.6-201ENST00000514228 1346 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 WFDC8-201ENST00000289953 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 SPATA45-201ENST00000332912 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 SNORD15A-201ENST00000384214 148 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 SNORA35-201ENST00000386104 128 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AL035467.1-201ENST00000403583 686 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AL034372.1-201ENST00000407586 754 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 MGAT2P1-201ENST00000449718 797 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 RN7SL608P-201ENST00000492377 279 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC103974.1-201ENST00000527285 874 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC084880.4-201ENST00000538405 577 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 DAZAP2-208ENST00000549555 872 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC004817.1-201ENST00000553621 721 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 TRIM69-204ENST00000558329 1211 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC233699.1-201ENST00000569955 1168 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC105243.1-202ENST00000583942 847 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 PINLYP-206ENST00000599207 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AL359745.1-201ENST00000626943 760 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 LINC00282-202ENST00000627246 4008 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 Z97989.1-201ENST00000531702 2421 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 EXPH5-203ENST00000525344 6542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 RNU1-38P-201ENST00000362817 144 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 PCOTH-201ENST00000382133 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AL024497.1-201ENST00000412954 631 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 RPSAP62-201ENST00000432596 833 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 HSD17B3-AS1-201ENST00000448857 1072 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 LINC01320-202ENST00000453774 1205 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 FAM74A1-201ENST00000465257 623 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 RN7SL152P-201ENST00000484176 298 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC117392.1-201ENST00000487061 596 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 ADI1P2-201ENST00000514945 429 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AP003032.1-201ENST00000526730 277 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AP000880.1-201ENST00000529416 743 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 IQCK-206ENST00000564186 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 RN7SL786P-201ENST00000579130 298 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AC138207.8-206ENST00000580053 637 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HLA-DQB1P01920 AL161725.1-210ENST00000590240 1224 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms