Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AC012560.1-203ENST00000510550 595 ntTSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 CCDC77-210ENST00000540180 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AC006141.1-201ENST00000581917 2170 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 ATP7B-206ENST00000448424 6404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 PDE1A-201ENST00000351439 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 ARMCX5-206ENST00000604957 4640 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 KBTBD11-OT1-204ENST00000635855 6169 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 CTAGE15-201ENST00000420911 2587 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 TACC2-207ENST00000369000 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 TANC2-201ENST00000389520 6404 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 NPFFR2-204ENST00000395999 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 STARD5-201ENST00000302824 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AC094019.1-201ENST00000434678 472 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
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PTPRMP28827 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
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PTPRMP28827 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
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PTPRMP28827 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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PTPRMP28827 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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PTPRMP28827 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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PTPRMP28827 ADGRB3-201ENST00000238918 2927 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
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PTPRMP28827 VPS41-202ENST00000310301 5903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
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PTPRMP28827 KALRN-211ENST00000460856 6509 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 SLC11A2-203ENST00000394904 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 NUSAP1-202ENST00000414849 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 STAU1-210ENST00000614381 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 PIGN-230ENST00000638977 4601 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
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PTPRMP28827 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
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PTPRMP28827 AL353572.3-201ENST00000636536 670 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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PTPRMP28827 SPTBN1-201ENST00000333896 9075 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 GC-201ENST00000273951 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 DAAM1-201ENST00000360909 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 SPEN-201ENST00000375759 12232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 ATG13-203ENST00000524625 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 TRIM44-201ENST00000299413 12964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 AL583856.1-201ENST00000454078 1101 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
PTPRMP28827 APAF1-211ENST00000552268 1143 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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