Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC096537.2-201ENST00000413707 714 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 GAPDHP19-201ENST00000431768 1005 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 OR6R1P-201ENST00000431838 940 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AL162427.1-201ENST00000450399 439 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 OR4Q2-201ENST00000541415 2778 ntAPPRIS P5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 PRICKLE2-AS1-201ENST00000482609 6505 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 ZNF793-201ENST00000445217 6712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 MPP7-201ENST00000337532 5080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 ZNFX1-204ENST00000396105 7371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 HMGN2P46-204ENST00000409454 1923 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 TSHZ2-203ENST00000603338 3803 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 UTY-209ENST00000537580 6490 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 ZRANB2-AS1-201ENST00000426999 607 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 PGM5P3-AS1-202ENST00000442069 615 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 ATP8B1-201ENST00000283684 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 ARPP21-220ENST00000441454 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 CNTRL-212ENST00000613863 2418 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 JAKMIP2-201ENST00000265272 6001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 POLH-201ENST00000372226 3322 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 MAPK10-323ENST00000641493 3207 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 SCRN1-202ENST00000409497 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 RBMXL1-202ENST00000399794 5084 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 ABLIM3-201ENST00000309868 4326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 RGS7-201ENST00000348120 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 OPCML-203ENST00000524381 6424 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 EBF2-204ENST00000535548 1017 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
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VPS8Q8N3P4 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 VTA1-202ENST00000367630 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 USF3-201ENST00000316407 13708 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 MYPN-201ENST00000354393 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 TBX15-201ENST00000207157 3492 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 NPM1P23-201ENST00000440193 849 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC005165.2-201ENST00000466070 380 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AGK-205ENST00000492693 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
VPS8Q8N3P4 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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