Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 PLEKHS1-207ENST00000619563 3247 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 HTATIP2-207ENST00000532081 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 CYP4A44P-201ENST00000569984 154 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ZNF585A-205ENST00000588354 596 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC008736.1-201ENST00000592431 568 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 SUN3-202ENST00000395572 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 SLC5A1-204ENST00000543737 4752 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 CRBN-203ENST00000432408 2203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 CD160-205ENST00000616463 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 NUDT4-206ENST00000549992 3607 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 MYO6-207ENST00000615563 4026 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 PALLD-206ENST00000505667 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ZNF415-214ENST00000597748 2461 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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HOXD10P28358 ASIC5-201ENST00000537611 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 OXCT1-205ENST00000510634 1441 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 LARP1P1-201ENST00000407692 292 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 LINC01384-201ENST00000422494 659 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 NMNAT1P3-201ENST00000457517 888 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AP000805.1-201ENST00000471604 784 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC084024.1-201ENST00000476186 621 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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HOXD10P28358 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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HOXD10P28358 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC7.9□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 CNIH1-205ENST00000556113 523 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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HOXD10P28358 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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HOXD10P28358 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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HOXD10P28358 LRRC37B-220ENST00000584368 2773 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.9□□□□□ -1.15
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HOXD10P28358 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 NUGGC-201ENST00000413272 3887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 GPBP1L1-201ENST00000290795 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 MED23-201ENST00000354577 4581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 VN1R66P-201ENST00000412929 916 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 MIR663AHG-237ENST00000615682 1030 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 BDNF-206ENST00000395983 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
HOXD10P28358 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
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