Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 BTG1P1-201ENST00000540396 508 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AL138974.1-201ENST00000551227 741 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC007066.2-201ENST00000561961 1993 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 NUP214-201ENST00000359428 7600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 CR1-206ENST00000400960 6959 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 NOX4-203ENST00000375979 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC117395.1-201ENST00000487390 403 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 XIST-206ENST00000434839 2865 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 FAM199X-202ENST00000493442 7457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 ARGFX-201ENST00000334384 992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 RNA5SP155-201ENST00000411154 129 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC005180.2-201ENST00000585620 562 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 ANAPC1-201ENST00000341068 8262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 RBPJ-201ENST00000342295 5860 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 USP13-203ENST00000496897 2747 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 HTR2C-202ENST00000371950 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 PHACTR2-201ENST00000305766 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 LRRC23-208ENST00000436789 796 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 SNX24-205ENST00000506996 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC022915.3-201ENST00000518620 594 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AZIN1-AS1-211ENST00000520455 480 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 RBM12-203ENST00000374114 6662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 RRP8-201ENST00000254605 6560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 LAMB4-202ENST00000388781 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 ZNF385D-201ENST00000281523 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 OR2T2-203ENST00000642130 3331 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 MTRNR2L8-201ENST00000536684 1303 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
VPS8Q8N3P4 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
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