Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 KCNIP4-204ENST00000382150 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 SLC15A1-202ENST00000376503 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 GPX6-204ENST00000612264 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC016930.1-201ENST00000468766 2205 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 MYT1L-AS1-202ENST00000448106 3230 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 PSG5-202ENST00000366175 1766 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 RPL34P19-201ENST00000415903 342 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AL022100.1-202ENST00000421214 548 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ABHD10-204ENST00000494817 801 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AL512428.1-201ENST00000562221 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC063977.7-201ENST00000594454 337 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC020915.3-201ENST00000595301 550 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC023513.1-201ENST00000604396 691 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AL161729.2-201ENST00000605700 456 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ZNF317-201ENST00000247956 4073 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 JAML-206ENST00000526620 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 BDNF-212ENST00000525528 4766 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 HNRNPU-223ENST00000640001 4227 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 KLHL32-207ENST00000620278 2642 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 LRRC8B-206ENST00000640258 8034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 SLC4A4-204ENST00000425175 7596 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 OR4F5-201ENST00000335137 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 OSBPL10-AS1-203ENST00000428872 538 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
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HOXD10P28358 ST13P6-201ENST00000522430 1102 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
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HOXD10P28358 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC011468.2-202ENST00000594362 579 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC007255.2-201ENST00000604053 631 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC073529.1-202ENST00000608576 1080 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 PCBP1-AS1-359ENST00000630283 1063 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC113615.1-201ENST00000507424 4121 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC061975.5-201ENST00000584928 1441 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 IL31RA-205ENST00000396836 2426 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 SYTL4-204ENST00000372989 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ZNF3-202ENST00000299667 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 AC087392.3-202ENST00000358446 1754 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 BAAT-201ENST00000259407 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 KIF21A-204ENST00000544797 5040 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 LINC01206-202ENST00000474045 2240 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 DHFR2-201ENST00000314636 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
HOXD10P28358 PLEKHS1-202ENST00000361048 3249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
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