Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC009743.1-201ENST00000415774 610 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC009500.1-201ENST00000420684 583 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AL356481.1-202ENST00000426704 970 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AL391863.1-202ENST00000457427 612 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 RPL5P15-201ENST00000475870 897 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 VDAC3-206ENST00000521158 949 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 SFTA3-210ENST00000521945 1116 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC138123.2-201ENST00000550324 579 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AL355102.4-201ENST00000553638 738 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC009119.1-202ENST00000567342 543 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AP006587.6-201ENST00000582128 1091 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 GCNT2-218ENST00000640968 939 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 OR5P3-202ENST00000641167 1193 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 ATP5BP1-201ENST00000411980 1574 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 CCR2-204ENST00000445132 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 CR1-203ENST00000367051 7469 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 BLNK-203ENST00000413476 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 MXI1-204ENST00000369612 879 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 TRAV22-201ENST00000390450 464 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 OR2H1-204ENST00000396792 1294 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AL713923.1-201ENST00000414071 378 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AP001468.1-201ENST00000415026 557 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AP001043.1-203ENST00000415824 407 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 CR391992.1-201ENST00000438601 394 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC009948.1-203ENST00000450044 793 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 HLTF-AS1-201ENST00000492461 415 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 TECRP2-201ENST00000503270 928 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC011410.1-201ENST00000524175 705 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC015914.1-201ENST00000558050 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 LINC00906-202ENST00000587998 648 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC006262.2-201ENST00000599127 612 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC015726.1-202ENST00000602532 475 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC012629.3-201ENST00000623397 328 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC073263.3-201ENST00000624449 858 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 ZNF227-213ENST00000621083 3055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC102941.1-201ENST00000567616 1537 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 SPECC1L-207ENST00000541492 3525 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 AC100858.3-201ENST00000533516 1605 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
ANKRD40Q6AI12 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms