Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CCDC32-210ENST00000559911 677 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC018845.1-201ENST00000564193 744 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC068724.2-201ENST00000565685 532 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MIR4793-201ENST00000577502 87 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 LAMTOR5-AS1-205ENST00000587691 441 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RPL23AP90-201ENST00000603820 236 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC093635.1-201ENST00000609028 555 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RNVU1-19-201ENST00000613023 167 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 pRNA.12-201ENST00000614353 90 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 pRNA.3-201ENST00000615048 90 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CCL4L2-216ENST00000620098 836 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MIR6723-201ENST00000621981 89 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RBBP4-206ENST00000458695 1674 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC090643.1-201ENST00000623600 3100 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 PPFIBP1-202ENST00000318304 6001 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 LMO3-208ENST00000441439 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 ITPR1-204ENST00000443694 9513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC007388.1-201ENST00000426083 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 KIAA0753-201ENST00000361413 4859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC009166.2-201ENST00000624410 2833 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 DCLRE1C-211ENST00000396817 2761 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AMBN-203ENST00000613447 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AP2B1-221ENST00000621914 5702 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 FCGR2A-202ENST00000367972 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 GOT2P1-201ENST00000440922 1309 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MAP3K7CL-203ENST00000341618 1855 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 ZMYND11-215ENST00000558098 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RGS6-205ENST00000406236 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 ZNF300P1-201ENST00000356555 1822 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RNA5SP301-201ENST00000362537 121 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RNA5SP149-201ENST00000364952 92 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC012358.1-201ENST00000366153 916 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RN7SKP261-201ENST00000410948 278 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 NRIR-202ENST00000414795 506 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 YWHAZP3-201ENST00000415292 738 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL445218.1-202ENST00000427695 845 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC092802.3-201ENST00000434207 420 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL137027.1-201ENST00000440358 444 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 ZNF197-AS1-201ENST00000447691 623 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 ATP5G1P6-201ENST00000451206 412 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AL035660.2-201ENST00000461248 556 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 NMNAT1P4-201ENST00000505598 840 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC131094.1-201ENST00000506984 490 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC079921.2-201ENST00000507579 455 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 LINC02270-202ENST00000515691 541 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RN7SKP14-201ENST00000516000 329 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 KCNU1-202ENST00000518904 334 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 C8orf44-205ENST00000521889 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 ZNF726-203ENST00000525354 806 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC044839.1-209ENST00000529769 878 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 TSPAN8-203ENST00000546561 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PDCD1Q15116 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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