Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
USP16Q9Y5T5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP16Q9Y5T5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms