Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q8

GTF3C5, General transcription factor 3C polypeptide 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5Q9Y5Q8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF3C5Q9Y5Q8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C5Q9Y5Q8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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