Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD2APQ9Y5K6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD2APQ9Y5K6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms