Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP1Q9Y3L3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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SH3BP1Q9Y3L3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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SH3BP1Q9Y3L3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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SH3BP1Q9Y3L3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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SH3BP1Q9Y3L3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SH3BP1Q9Y3L3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
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