Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAK1Q9UPV9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRAK1Q9UPV9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms