Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCAF8Q9UPN6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCAF8Q9UPN6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms