Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNTN3Q9P232 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms