Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC41.03■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC41■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC41■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CCDC180Q9P1Z9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms